【Experimental Log】2015/5/3-4

6 Sample:760 (B. schaaliae), 726 (B. aristatoserrulata), CP115 (B. schaaliae), CP92 (B. ravenii), CP97 (B. hayatana), CP116 (B. tarokoensis)

DNA extraction:CTab (測量葉片用量為760和762為0.1 g,其餘CP系列皆為0.05 g, CP116為0.09)。在65度時放入搖晃機中,約莫一小時,此次只用震盪機 (50 1/s*3 mins)*3 (一顆大、兩顆中、兩顆小鋼珠),開始前要將葉子先撥碎。總體積用50 (-1) ug去溶。皆有過Colum。

NanoDrop (曲老師實驗室):760 (B. schaaliae)155.1(111.7) ug/mL, 1.86(1.93) 260/280, 2.19(5.68) 260/230, 726 (B. aristatoserrulata)77.8 ug/mL, 1.85 260/280, 2.17 260/230, CP115 (B. schaaliae)69.5 ug/mL, 1.85 260/280, 2.40 260/230, CP92 (B. ravenii)15.5 ug/mL,1.74 260/280, 0.92 260/230, CP97 (B. hayatana)21.2 ug/mL, 1.91 260/280, 21.2 260/230, CP116 (B. tarokoensis)170.7 ug/mL, 1.39 260/280, 0.68 260/230。[760, 726, CP115 曲線OK!!!]

Note:這次做了五種不同種的小檗。也有同種(花蓮小檗)新舊(2015和2009)的比較。發現,種在抽取DNA的品質差異很大。明顯發現,花蓮小檗的保存皆較優。有幾個特點:厚薄 (如 太魯閣和南投算厚;早田氏和南台灣算薄;台灣和長葉這類算適中,在老葉和嫩葉亦存在同樣狀況。) 顏色 (有黑斑、或放太久已全變深咖啡,已經無法使用;但咖啡偏綠粉綠情況為最佳。) 大小 (越完整,越大越好,故老葉為佳,保存時盡量不要壓碎,在採的時候也要盡量挑大的葉子。) 保存的方式似乎沒有差異太大,皆由矽膠乾燥,故變因主要就為葉片本身。尚未找到厚葉或薄葉類型的小檗要如何抽到最高品質DNA,假設為:新鮮時,最好一個禮拜內實驗。(使用溫室活體做測試。) 此次實驗皆此用鋼珠震盪機打碎。

繼續加油。

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