【Experimental Log】2015/6/19-20

10 Sample:888 (B. breviesepala), 898 (B. breviesepala), CP92 (B. ravenii), CP95 (B. ravenii), CP140 (B. chingshuiensis), CP141 (B. chingshuiensis), CP146 (B. mingetsensis), CP147 (B. mingetsensis), nato1 (B. nantoensis), nato2 (B. nantoensis)

DNA extraction:CTab (電子天平壞了。) 在65度時放入搖晃機中,約莫一小時,此次只用震盪機 (50 1/s*3 mins)*3 (一顆大、兩顆中、兩顆小鋼珠),開始前要將葉子先撥碎。總體積用50 (-1) ug去溶。皆有過Colum。

NanoDrop (曲老師實驗室):888 (B. breviesepala)79.8 ug/mL,1.86 260/280, 2.29 260/230, 898 (B. breviesepala)79.3 ug/mL, 1.84 260/280, 2.39 260/230, CP92 (B. ravenii)98.6 ug/mL, 1.88 260/280, 2.22 260/230, CP95 (B. ravenii):- ug/mL, – 260/280, – 260/230, CP140 (B. chingshuiensis)182.8 ug/mL, 1.31 260/280, 0.67 260/230, CP141 (B. chingshuiensis):- ug/mL, – 260/280, – 260/230, CP146 (B. mingetsensis)91.9 ug/mL, 1.83 260/280, 2.10 260/230, CP147 (B. mingetsensis)53.9 ug/mL, 1.8 260/280, 1.84 260/230, nato1 (B. nantoensis)54.0 ug/mL, 1.9 260/280, 2.67 260/230, nato2 (B. nantoensis):- ug/mL, – 260/280, – 260/230。[888波美,其餘有濃度的後面都有小小波。]

這次都挑了以往認為非常難的種類抽,很高興未在ㄓㄐ採集紀錄中的一批高山小檗,竟有了結果 (而且還是模式產地的),這點倒是很感人。冷藏矽膠標本的方式到底有沒有用,其實沒有顯示太好結果,兩支南投小檗,僅出來一支。繼上次兩支清水山都失敗之後,這次清水山有出來一支,算欣慰。這次去阿里山的眠月小檗,似乎也要快點抽DNA了!這次DNA濃度較以往偏低,不知道是因為沒有再秤過,用目視量所導致,還是因為這次都挑難抽的種類的原因,還需要再多做實驗,才能得知。持續加油,也要弄懂NGS回來的資料,因為又是全新的東西,覺得很有趣,希望能一直保持下去。

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【Trekking Log】20150616 眠月

和ㄓㄐ、宜軒、宜軒哥、阿倫。

四點台北出發,被雨好不留情地困住。雖因如此,我卻有一種,這次將會是別具意義的一趟採集。

那是關於傳承。ㄓㄐ學長決定帶我們去一趟眠月線時,去瞧瞧稀有的眠月小檗。這要多少幸運?若有人花了好幾年嘗試多少失敗、累積多少努力,就這樣,願意輕易地讓我觸及,是否受寵若驚?踢著舊鐵道,聽著學長訴說著,那一個點是第一次揭開神秘小檗的面紗,那份興奮和驚奇,似乎還殘留在林間,悄悄注入我的情緒,擴散開來。

穿過一次又一次的山洞,跳過一階又一階的舊鐵軌。

到了石猴車站,一個被山收回的車站。至末,獨自走到盡頭的廢棄山洞,霧濃、林下昏陰,迴響飄渺而恐懼,說不上來。感覺文明被拋到後頭,好久沒有這樣孤獨到會害怕的感受。便急忙逃回原始與現實間的模糊地帶,安然。

或許我們到未來的某一個時間點,需要開始回想,說出一篇故事,關於自己、山林,還有你們。

【Experimental Log】2015/6/2-3

8 Sample:CP132 (B. schaaliae), CP139 (B. chingshuiensis), CP139i (B. chingshuiensis), CP141 (B. chingshuiensis), 698 (B. breviesepala), 723 (B. hayatana), 741 (B. aristatoserrulata), 765 (B. kawakamii)

DNA extraction:CTab (電子天平壞了。) 在65度時放入搖晃機中,約莫一小時,此次只用震盪機 (50 1/s*3 mins)*3 (一顆大、兩顆中、兩顆小鋼珠),開始前要將葉子先撥碎。總體積用50 (-1) ug去溶 (CP132 -2)。皆有過Colum。

NanoDrop (曲老師實驗室):CP132 (B. schaaliae)107.4 ug/mL, 1.84 260/280, 2.26 260/230, CP139 (B. chingshuiensis):- ug/mL, – 260/280, – 260/230, CP139i (B. chingshuiensis):- ug/mL, – 260/280, – 260/230, CP141 (B. chingshuiensis):- ug/mL, – 260/280, – 260/230, 698 (B. breviesepala)21.9 ug/mL, 1.67 260/280, 1.34 260/230, 723 (B. hayatana)103.8 ug/mL, 1.92 260/280, 1.64 260/230, 741 (B. aristatoserrulata)156.5 ug/mL, 1.83 260/280, 2.03 260/230, 765 (B. kawakamii)123.9 ug/mL, 1.84 260/280, 2.14 260/230。[高山小檗breviesepala波圖稍不好,濃度稍低,可是竟然抽出來了。]

Note:清水山小檗全部沒有結果。CP139i是CP139同樣本,但是是使用冰箱保存,依然沒有濃度。很怪,再抽的時候,過程可以看到他們的雜質很少,在overnight後,離心沉澱也是透明白色,感覺狀況很好,但最後DNA到底去哪了。CP132是同趟採的花蓮小檗,依然有濃度,排除保存問題,這次同種的清水山小檗皆無濃度,推測有可能為種的差異。第一次高山小檗有抽到濃度,希望能用。台灣小檗依然很給面子。這次沒有秤重,以過去經驗目視,清水山小檗因為"感覺"比較新鮮,放比較少,不知道有沒有影響。然後兩棵清水山小檗都死了,者可能是近期最難過的事。

最近和老師出去,皇帝殿、東北角海邊,很有收穫 (除了被蜜蜂叮和摔傷右半邊屁股以外)。淼來台北工作了,住在松山,饒河夜市旁邊。

反正就沒有理由的悶,不太想說話。

六月了。