【Experimental Log】2016/08/19-20

8 Samples:CP239 (Berberis deinacantha), CP240 (Berberis deinacantha), CP241 (Berberis deinacantha), CP242 (Berberis grodtmanniae), CP243 (Berberis dumicola), CP244 (Berberis sanguinea), CP245 (Berberis kawakamii), CP246 (Berberis breviesepala)

DNA extraction:CTab (為乾燥材料,均質機打碎。一片葉子一管。) 總體積用50 ug去溶。[CP243 , CP244的狀況不好,抽了兩次 (8/19、20)。]

純化kit:Monarch™ PCR & DNA Cleanup Kit (5 μg) (NEB)

DNA定量:Qbit

Qbit結果

CP239 (Berberis deinacantha):too high ng/uL, CP240 (Berberis deinacantha):110 ng/uL, CP241 (Berberis deinacantha):too high ng/uL, CP242 (Berberis grodtmanniae):110 ng/uL, CP243 (Berberis dumicola):46.4 ng/uL, CP244 (Berberis sanguinea):15.8 ng/uL *(CP224的顏色很髒,在原液時,就有很多不明析出漂浮物,純化時無法清除顏色。)

CP243 (Berberis dumicola):82.6 ng/uL, CP244 (Berberis sanguinea):36.8 ng/uL, CP245 (Berberis kawakamii):83.4 ng/uL, CP246 (Berberis breviesepala):too high ng/uL *(這次沒有放overnight,只有三個小時,葉子放的量也減少,純化後顏色皆為透明。)

跑膠結果:

P1010428.JPG

結論:感覺CP224可以純縮成一管。其他的狀況都還算OK。已經可以正確判別葉子狀況適不適合抽出高純度DNA了。不適合,就也只能以量取勝法,來得到所需濃度和品質。

廣告