【Experimental Log】2017/09/19-28

29個紅豆樹數的Samples:

Number

Species

Champ

peng24773

Ormosia emarginata (Hook. et Arn.) Benth. 凹葉紅豆

1

peng24782

Ormosia fordiana Oliver 肥莢紅豆

2

61B

Ormosia pachycarpa Champ. ex Benth. 茸莢紅豆

3

65B

Ormosia indurata H.Y. Chen 韌莢紅豆

4

66B

Ormosia semicastrata Hance 軟莢紅豆

5

69B

Ormosia pachycarpa Champ. ex Benth. 茸莢紅豆

6

70B

Ormosia indurata H.Y. Chen 韌莢紅豆

7

71B

Ormosia emarginata (Hook. & Arn.) Benth. 凹葉紅豆

8

KFC3472

Ormosia pachycarpa Champ. ex Benth. 茸莢紅豆

9

KFC3550

Ormosa pinnata (Loureiro) Merrill 海南紅豆

10

KFC3551

Ormosia henryi Prain 花櫚木

11

KFC3552

Ormosia glaberrima Y.C. Wu 光葉紅豆

12

KFC3554

Ormosia pachycarpa Champion ex Bentham 茸莢紅豆

13

KFC3555

Ormosia merrilliana L.Chen 雲開紅豆

14

KFC3556

Ormosia balansae Drake 長臍紅豆

15

KFC3564

Ormosia

16

KFC3567

Ormosia glaberrima Y.C. Wu 光葉紅豆

17

KFC3568

Ormosia semicastrata Hance 軟莢紅豆

18

KFC3569

Ormosia fordiana Oliver 肥莢紅豆

19

KFC3571

Ormosia fordiana Oliver 肥莢紅豆

20

KFC2991

Ormosia hosiei Hemsl. & E.H. Wilson 紅豆樹

21

KFC2992

Ormosia hosiei Hemsl. & E.H. Wilson 紅豆樹

22

XWB13254

厚莢紅豆

23

y2596

小葉紅豆

24

y2695

小葉紅豆

25

y3101

肥莢紅豆

26

KFC3089

Ormosia hengchuniana 恆春紅豆樹

27

Torke1573

Ormosia holerythra

28

Michelangeli2047

Ormosia costulata

29

DNA extraction :皆使用CTab (未秤重,目視約一片正常大小葉子,加入液態氮磨碎。) 最後總體積用50 uL去溶。(使用過DNeasy Plant Mini Kit效果不佳。)

跑膠結果:

 

DNA定量:nanodrop (除29以外,濃度和品質皆佳。)

 

PCR(MasterMix 12.5uL, Primer L端 1uL,Primer F端 1uL, DNA 1uL, NgCL2 1.5uL, H2O 8uL,總體積為25uL):

ITS4 – ITS5

(A)

trnL – trnF

(B)

trnK685F – trnK2R

(C)

matK4La – matK1932Ra

(D)

1

9/15/17

1

9/15/17

29

9/15/17

15

2

9/15/17

2

Double Bind  9/26 切膠

9/15/17

30

9/15/17

16

3

9/15/17

3

D 9/26 切膠

9/15/17

31

9/15/17

17

4

9/15/17

4

D 9/26 切膠

9/15/17

32

9/15/17

18

5

9/15/17

5

D 9/26 切膠

9/15/17

33

9/15/17

19

6

9/14/17

1

9/15/17

34

9/14/17

3

7

9/15/17

6

D 9/26 切膠

9/15/17

35

9/15/17

20

8

9/15/17

7

9/18/17

1

9/15/17

21

9

9/15/17

8

D 9/26 切膠

9/18/17

2

9/15/17

22

10

9/15/17

9

D 9/26 切膠

9/18/17

3

9/15/17

23

11

9/14/17

4

9/18/17

4

9/14/17

6

12

9/15/17

10

D 9/26 切膠

9/18/17

5

9/15/17

24

13

9/15/17

11

D 9/26 切膠

9/18/17

6

9/15/17

25

14

9/15/17

12

D 9/26 切膠

9/18/17

7

9/15/17

26

15

9/15/17

13

9/18/17

8

9/15/17

27

16

9/15/17

14

9/18/17

9

9/15/17

28

17

9/17/17

1

D 9/26 切膠

9/18/17

10

9/17/17

14

18

9/17/17

2

D 9/26 切膠

9/18/17

11

9/17/17

15

19

9/17/17

3

D 9/26 切膠

9/18/17

12

9/17/17

16

20

9/17/17

4

D 9/26 切膠

9/18/17

13

9/17/17

17

21

9/17/17

5

9/18/17

14

9/17/17

18

22

9/17/17

6

D 9/22 切膠

9/18/17

15

9/17/17

19

23

9/17/17

7

D 9/22 切膠

9/18/17

16

9/17/17

20

24

9/17/17

8

9/18/17

17

9/17/17

21

9/28/17

25

9/17/17

9

9/18/17

18

9/17/17

22

 9/28/17

26

9/17/17

10

D 9/26 切膠

9/18/17

19

9/17/17

23

27

9/17/17

11

9/18/17

20

9/17/17

24

28

9/17/17

12

 

9/18/17

21

9/17/17

25

 

29

9/17/17

13

9/18/17

22

9/17/17

26

純化:主要使用ExoSAP。若有切膠或單純純化,使用Viogen PCR Advanced PCR Clean Up System。

送定序 (PCR原液 1uL, 單邊primer 0.5, 水 8.5):四組primer(依順序為A, B, C, D)搭配不同樣品材料編號,為送定序代號。

目前:等定序結果。

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