20181018 RAD-Seq Library備置測試

接續20181017 RAD-Seq Library備置測試使用NEBNext® Ultra™ II DNA Library Prep Kit for Illumina®的protocol。

1.1 NEBNext End Prep

使用10/17這管,20ul(濃度31.6ng/ul)開始此步驟。這管全部接續下面步驟。(此kit建議起始DNA量:500pg~1ug,故為符合。)補水30ul,達kit要求體積50ul。

1.2 Adaptor Ligation

10/17使用新的P2 Adapter 1ul。

1.3 Size Selection or Cleanup of Adaptor-ligated DNA

上一步最後總體積為93.5ul,接續此步驟。

1.4 PCR Enrichment of Adaptor Ligated DNA

1.5 Size Selection or Cleanup of Amplification

膠圖很糟,需要再重跑10/18 Final(擴增並且最後一步Size Selection結束。)RAD template已用完。從濃度來看,應有擴增,但效率不佳。

USER 2018-10-18 16hr 13min.jpg

___________________________________

接續

1. 重新跑10/18 Final的膠,確定片段大小。(*20181023更新:已重新跑膠。)

2. 從樣本合併剩餘樣本(約剩17ul)開始。

 

USER 2018-10-23 09hr 47min

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